От началото на пандемията диагностичните тестове изиграха жизненоважна роля в контролирането на разпространението на SARS-CoV-2, вирусът, който причиняваCOVID 19.Бързи антигенни тестовеизвършени у дома или в клинична среда дават резултати за 15 минути или по-малко.Колкото по-рано се диагностицира човек, толкова по-скоро може да потърси медицинска помощ и да се изолира от другите.Но когато се появят нови варианти на вируса, тези варианти може да не бъдат открити от тези тестове.
Повечето бързи антигенни тестове са предназначени за откриване на нуклеокапсидния протеин или N-протеина на SARS-CoV-2.Този протеин се намира в изобилие във вирусни частици и заразени хора.Комплект за бърз тестобикновено съдържат две различни диагностични антитела, които се свързват с различни части на N протеина.Когато антитяло се свърже с N протеина в проба, върху тестовия комплект се появява цветна линия или друг сигнал, което показва инфекция.
Протеин N се състои от 419 аминокиселинни структурни единици.Всяка от тях може да бъде заменена с друга аминокиселина чрез мутация.Изследователска група, ръководена от д-р.Филип Франк и Ерик Ортлунд от университета Емори се заеха да проучат как тази единична аминокиселинна промяна влияе на ефективността на бърз антигенен тест.Те са използвали техника, наречена дълбоко сканиране на мутации, за да оценят едновременно как всяка мутация в N протеина на вируса засяга свързването с диагностично антитяло.Техните резултати бяха публикувани в Cell на 15 септември 2022 г.
Изследователите създадоха изчерпателна библиотека от близо 8000 N протеинови мутации.Тези варианти представляват повече от 99,5% от всички възможни мутации.След това те оцениха как всеки вариант взаимодейства със 17 различни диагностични антитела, използвани в 11 налични в търговската мрежа бързи антигенни теста, включително общидомашни комплекти.
Екипът оцени кои N-протеинови мутации влияят върху разпознаването на антитялото.Въз основа на тази информация те създадоха „профил на избягала мутация“ за всяко диагностично антитяло.Този профил идентифицира специфични мутации в N протеина, които могат да повлияят на способността на антитялото да се свързва с неговата мишена.Анализът показа, че антителата, използвани в днешните бързи тестове, разпознават и свързват всички минали и настоящи варианти на SARS-CoV-2, които предизвикват загриженост и безпокойство.
Въпреки че няколко диагностични антитела разпознават една и съща област на N протеина, изследователите откриха, че всяко антитяло има уникален подпис на мутациите за избягване.Тъй като вирусът SARS-CoV-2 продължава да мутира и да генерира нови варианти, тези данни могат да се използват за маркиране на антитела в комплекта за тестване, които може да се наложи да бъдат преоценени.
„Точното и ефективно идентифициране на заразените лица остава критична стратегия за смекчаване на COVID-19 и нашето проучване предоставя информация за бъдещи мутации на SARS-CoV-2, които биха могли да попречат на откриването“, каза Ортлунд.„Резултатите, описани тук, ни позволяват бързо да се адаптираме към този вирус, тъй като продължават да се появяват нови варианти, представящи непосредствени клинични последици и последици за общественото здраве.“
Предистория: Дълбокото сканиране на мутации открива избягващи мутации в нуклеокапсида на SARS-CoV-2 с помощта на наличните в момента бързи антигенни тестове.Франк Ф., Кин М.М., Рао А., Басит Л., Лиу Х., Бауърс Н.Б., Пател АБ, Като М.Л., Съливан JA, Грийнлийф М., Пиантадоси А., Лам VA, Хъдсън VH, Ortlund EA cell.15 септември 2022 г.; 185 (19): 3603-3616.e13.Министерство на вътрешните работи: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29 август 2022 г. PMID: 36084631.
Финансиране: Национален институт за биомедицински изображения и биоинженерство NIH (NIBIB), Национален институт по диабет, храносмилателни и бъбречни заболявания (NIDDK) и Национален институт по алергии и инфекциозни заболявания (NIAID), Американска кардиологична асоциация.
NIH Research Matters е седмична актуализация на ключови резултати от изследвания на NIH, прегледани от експерти на NIH.Публикува се от Службата за комуникации и връзки с обществеността на директора на Националните здравни институти.